尼帕病毒精準防控：NGS 技術筑牢感染防線

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據媒體報道，近日印度西孟加拉邦發生尼帕病毒疫情，截至 1 月 23 日，共確診了 5 例病例。我國尚無尼帕病毒病病例報告。

認識 “尼帕病毒”

1. 病原學：尼帕病毒屬于副粘病毒科（Paramyxoviridae）亨尼帕病毒屬（Henipavirus）。病毒顆粒呈多形性，直徑 150-300nm，最外層為脂蛋白包膜，核衣殼呈螺旋對稱。2. 宿主及傳播途徑：天然宿主主要為果蝠。尼帕病毒主要通過以下方式傳播到人：（1）直接接觸被病毒感染的動物（如果蝠、豬、馬等）或其體液（如血液、尿液、唾液等）。

（2）食用被病毒感染動物的體液、分泌物或排泄物所污染的食品（如被果蝠污染的水果）。

（3）密切接觸被病毒感染的病人或其體液（包括鼻咽分泌物、尿液或血液等）。尼帕病毒病人際間傳播主要發生在病例家庭和醫療機構。

（4）有氣溶膠傳播的文獻報道。

3. 易感人群：

人對尼帕病毒普遍易感，特別是生豬養殖場或肉類加工廠從業人員等職業暴露人群是感染的高風險人群。

感染嚴重性

尼帕病毒感染的嚴重性體現在臨床表現隱匿性強和致死率高特征。一是臨床表現多樣，隱匿性強。根據 WHO 報告，尼帕病毒感染的潛伏期（從感染到出現癥狀的時間間隔）為 4~14 天，最長可達 45 天。初期初期癥狀與流感相似，表現為發熱、頭痛、肌痛、咽痛、嘔吐等癥狀，隨后可快速進展為病毒性腦炎，導致嗜睡、定向障礙、抽搐、昏迷；或引發急性呼吸窘迫綜合征，出現嚴重呼吸困難；二是病死率高，人感染尼帕病毒病死率可高達 40%-75%。

鑒于缺乏有效治療手段，早期發現、隔離病例、追蹤接觸者以及加強感染控制措施是防控的關鍵。

感染患者早期精準快速診斷

在應對尼帕病毒這類新發、高對人類健康危害嚴重的，早期識別、精準診斷和科學防控是應對的關鍵。杰毅 Q-mNGS 技術，檢測范圍覆蓋 35257 種病原微生物，可在 13 小時內快速檢測、精準鑒定罕見、新發病原體，完成從樣本到報告的流程，為傳染病的精準鑒別、快速診斷提供關鍵技術支撐。

新發突發傳染病實時監測和預警

SSR-mNGS 是杰毅病原宏基因組數據分析軟件 (MS003) 是杰毅生物自主研發的病原宏基因組數據分析系統，具備強大的分析能力，致力于提供快速、精準的微生物鑒定服務。該軟件包含病原宏基因組分析、極速分析、進化分析三大功能模塊，滿足客戶多元化微生物鑒定和學術研究需求，同時可助力搭建傳染病實時監測和預警平臺。

公眾如何防護？

目前，尚無針對尼帕病毒病的特異性抗病毒藥物和獲批上市的疫苗，采取有效的預防措施至關重要：避免接觸潛在傳染源：避免接觸蝙蝠，尤其是果蝠及其分泌物、排泄物，不要食用蝙蝠可能接觸過的食物或水源。

加強家畜管理：對養豬場等家畜飼養場所進行定期消毒，防止蝙蝠糞便等污染物進入飼料或水源。

加強個人防護：非必要不前往尼帕病毒病流行地區；確需前往的，應做好個人防護，避免接觸野生動物、病死動物及可疑污染物；嚴禁生食或飲用未經處理的生鮮食品和飲品；在處理可能受尼帕病毒污染的物質時，應佩戴手套、口罩和防護服，避免直接接觸。

及時就醫：如在疫區旅居或有可疑接觸史后出現發熱、頭痛、等癥狀，應立即前往醫療機構就診，并主動告知醫生相關流行病學史，以便及時診斷和治療。

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流感樣病例數創近四年新高，混合感染風險激增

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流感警報，全國多地拉響

最近，全國的流感陽性率均保持高位。多地學校停課，感染范圍擴大，流感警報正在全國多地拉響！

先看國家疾控中心發布的三個關鍵信息：第一，全國已有 17 個省份進入流感高流行狀態；第二，今年的疫情勢頭已超過去三年同期；第三，這波高峰，還在繼續攀升。

圖 1:2022-2026 年度中國南方、北方省份哨點醫院流感樣病例（來源：中國疾病預防控制中心）

圖中 4 條不同顏色的曲線，分別代表 4 個監測年份的數據。監測一般自每年第 14 周（約 3 月中旬）開始。其中，綠色曲線為 2022-2023 年數據，紅色曲線為當前監測年（2025-2026 年）數據。
無論是南方（圖 1）還是北方（圖 2），截至第 48 周（約 11 月底），代表今年的紅色曲線均已明顯高于其他年份同期水平，當前流感流行強度已創下近年新高。
從杰毅生物流感病毒檢測頻率統計可見，2025 年 10 月以來流感病毒檢出頻率呈現升高趨勢，截至 12 月初檢出率已接近 2024 年最高水平。

圖 2. 杰毅生物甲型流感病毒檢出頻率

甲流 H3N2，關注高危人群并發癥

根據國家疾控中心數據，甲型 H3N2 亞型流感病毒仍然占流行優勢，占比超過 95%，有少量甲型 H1N1 和乙型流感病毒同期流行。甲型流感病毒感染病例中，5~14 歲病例組檢測陽性率明顯高于其他年齡組。

重點人群和高風險人群包括：60 歲及以上的老年人，罹患一種或多種慢性病患者，養老機構、長期護理機構、福利院等聚集場所的居住人員和員工，孕婦，6 月齡到 5 歲兒童，6 月齡以下嬰幼兒的家庭成員和看護人員，托幼機構、中小學校、醫療機構、監管場所等重點場所人群。

WHO 明確界定的流感高危人群，其并發癥發生率和死亡率遠高于普通人群，具體差異如下：

多種病毒混合感染，警惕重癥

今年的呼吸道傳染病流行呈現出多病原共循環的復雜態勢。除了流感病毒外，呼吸道合胞病毒（RSV）、腺病毒等多種病原體也處于活躍狀態。臨床上，部分患者在短期內可能連續感染不同病原體，也有病例出現甲型與乙型流感病毒的混合感染。

圖 3. 哨點醫院門急診流感樣病例呼吸道樣本病原體核酸檢測陽性率每周變化趨勢

圖 4. 杰毅生物呼吸道 RNA 病毒檢出趨勢

混合感染會引發更強烈的全身炎癥反應，導致肺部損傷加重，顯著增加重癥肺炎、呼吸衰竭的發生風險。美國 CDC2024 年報告指出，H3N2 與新冠共感染的住院患者中，近三成發展為重癥。在當前多種呼吸道病毒共同流行的季節，我們更應提高警惕，做好科學防護，降低混合感染、重癥感染的發生可能。

精準快速病原體檢測、實時監測方案

呼吸道傳染病的高發期，病原體檢測數據對疾病預防和治療至關重要。為醫療機構 NGS 本地化運營打造的 “毅達 Lab” 數智化實驗室信息系統，引入 AI 智能審核，確保每一份報告的及時性和準確性。多維度數據看板則將復雜數據轉化為清晰洞察，可實時掌握病原動態，精準預警潛在風險，真正實現病原數據的可知、可控、可預測。

面對混合、重癥呼吸道感染，一次性精準篩查數百種常見流行病原體的 tNGS 技術，成為明確病因的高效檢測方法。杰毅生物 SeqPlex?tNGS 呼吸采用多重擴增酶切法建庫, 對常見及重點關注的呼吸系統感染相關的 324 種病原核酸進行靶向擴增富集, 結合高通量測序技術, 實現對呼吸系統感染病原體廣譜精準檢測，助力臨床提高診斷效率。

呼吸道合胞病毒與流感雙重威脅，重點人群如何應對感染風險？

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呼吸道傳染病高發季

根據國家疾控中心最新監測數據，我國已進入呼吸道傳染病高發季節，流感活動逐步進入快速上升階段，腸道病毒、鼻病毒和呼吸道合胞病毒等也存在一定水平活動。

表 1. 第 44 周呼吸道樣本主要病原體核酸檢測陽性率區域差異

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南方省份包括：上海、江蘇、浙江、安徽、福建、江西、湖北、湖南、廣東、廣西、海南、重慶、四川、貴州和云南。
北方省份包括：北京、天津、河北、山西、內蒙古、遼寧、吉林、黑龍江、山東、河南、西藏、陜西、甘肅、青海、寧夏、新疆和新疆生產建設兵團

近期活躍的呼吸道合胞病毒、流感病毒有哪些新的動向，哪些人群需要重點防護？

呼吸道合胞病毒，幼兒混合感染危害重

近期，呼吸道合胞病毒（RSV）檢測陽性率仍處高位波動，北方省份呈上升趨勢、南方省份波動下降。杰毅生物 RSV 檢出頻率顯示，今年秋季 RSV 檢出頻率顯著高于去年同期水平。

圖 1. 杰毅生物呼吸道合胞病毒檢出頻率

呼吸道合胞病毒是一種主要影響嬰幼兒呼吸道的病毒，是嬰兒病毒感染死亡的第二大常見原因。數據顯示，0-4 歲幼兒是 RSV 感染率最高的年齡段。尤其在我國南方省份，該年齡組的 RSV 陽性率持續高于其他年齡組。RSV 混合感染往往導致病程延長、病情加重。浙江省疾控中心一項針對 7857 名 RSV 住院患兒的研究顯示，約有 20.4% 的患兒存在混合感染。細菌合并感染病例中，肺炎支原體是主要病原體（59.2%），其次是肺炎鏈球菌（25.3%）和流感嗜血桿菌（8.8%）。在病毒合并感染病例中，人類鼻病毒是最常檢測到的病原體，占 27.3%，其次是巨細胞病毒（23.8%）和人類腺病毒（14.0%）。

重癥呼吸道合胞病毒感染可導致嚴重并發癥，包括心血管及神經系統并發癥，包括心力衰竭、腦炎等。越來越多的研究從不同角度揭示，嬰兒期呼吸道合胞病毒感染可對呼吸系統帶來損傷，甚至持續到成年時期。如患兒出現嚴重癥狀，如呼吸急促、呼吸困難和持續高燒不退，應及時就醫，及早診斷，避免延誤治療。

杰 Sir TIPS：

1. 目前國內外尚無用于嬰兒的針對 RSV 感染的疫苗上市。我國目前批準了 RSV 單克隆抗體，通過被動免疫方式來保護嬰幼兒降低感染風險。

2. 當患者出現呼吸急促、費力、嘴唇發紺、體溫達 38.5℃持續不退，精神萎靡、不吃不喝等癥狀，請及時就醫。

流感來襲，新毒株傳播范圍更大

根國家疾控中心第 44 周流感監測周報，近期流感活動上升明顯，絕大多數省份都已進入流感流行期。從杰毅生物流感病毒檢測頻率統計可見，今年 10 月以來流感病毒檢出頻率呈現升高趨勢。

圖 2. 杰毅生物流感病毒病毒檢出頻率

今年流感在南方省份活動明顯增強，區別于去年的甲型 H1N1，今年流行毒株以甲型 H3N2 為主。這意味著，由于我國人群對 H3N2 的免疫背景相對薄弱，病毒將更容易傳播，可能造成比往年更大范圍的感染，公眾需格外重視并做好防護。

表 2. 流感樣病例監測實驗室檢測結果

H3N2 與 H1N1 流感病毒感染所引起的癥狀高度相似，均表現為典型流感綜合征，核心癥狀包括：高熱（體溫常超過 39°C）、明顯乏力、全身肌肉酸痛、頭痛、咳嗽及喉嚨痛。部分患者（尤其在兒童群體中）也可能出現胃腸道癥狀，如惡心、嘔吐或腹瀉。盡管臨床癥狀相近，兩者在流行病學與重癥特征上存在差異?！读~刀》一項基于十年數據的研究顯示，在 H3N2 主導的流行季，總體住院率更高；而因甲型 H1N1pdm09 住院的患者，病情進展風險更大，其入住 ICU 或接受機械通氣/體外膜肺氧合（ECMO）治療的比例更高。

從易感人群來看，H1N1 在年輕成人及肥胖患者中引發重癥的風險較高；H3N2 則對老年人與兒童的影響更為顯著。研究顯示兒童感染 H3N2 后，除高熱外，發熱持續時間可能更長，且更易繼發支氣管炎、肺炎等并發癥。

杰 Sir TIPS：
1. 接種流感疫苗是最有效的預防措施之一，三價和四價流感疫苗均覆蓋所有流行的季節性流感病毒的型別和亞型。
2. 出現高熱、肌肉酸痛等典型癥狀請及時就醫，及早診斷和治療，在癥狀出現 48 小時內進行抗病毒藥物治療效果最佳，注意：服用抗生素對流感病毒無效，須在醫生指導下使用抗病毒藥物。

杰毅生物精準快速病原體檢測、實時監測方案

呼吸道傳染病的高發期，多種病原體共循環已成為新常態。發熱、咳嗽等癥狀的病因復雜多樣。常規檢測方法難以覆蓋全部病原體，極易造成漏檢。一次性精準篩查數百種常見流行病原體的 tNGS 技術，成為明確病因的高效檢測方法。杰毅生物 SeqPlex?tNGS 呼吸采用多重擴增酶切法建庫, 對常見及重點關注的呼吸系統感染相關的 324 種病原核酸進行靶向擴增富集, 結合高通量測序技術, 實現對呼吸系統感染病原體廣譜精準檢測，助力臨床提高診斷效率。

為醫療機構 NGS 本地化運營打造的 “毅達 Lab” 數智化實驗室信息系統，引入 AI 智能審核，確保每一份報告的及時性和準確性。多維度數據看板則將復雜數據轉化為清晰洞察，可實時掌握病原動態，精準預警潛在風險，真正實現病原數據的可知、可控、可預測。

突破 FUO 診療困境，杰毅 Onco-mNGS 腫瘤提示科研文章合集（一）

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不明原因發熱（FUO）是臨床常見的醫療難題，由于病因復雜，診斷困難，約 51% 的患者難以確診，其中惡性腫瘤病例占比約 14%。當前 FUO 患者死亡率仍然高達 12-35%，這類患者往往初診優先考慮感染性疾病，易導致腫瘤被忽視，造成誤診或延遲診斷。因此，實現感染與腫瘤的早期精鑒別至關重要。杰毅生物基于 40 萬臨床大數據，在行業內率先推出定量 Onco-mNGS 檢測技術，在一次 mNGS 檢測中，通過人源背景數據的染色體拷貝數變異分析（CNV），在鑒定病原體的同時特異性提示腫瘤信號，為 FUO 的精準病因鑒別與診療提供了高效解決方案，實現新的診療突破。

為驗證 mNGS 病原檢測和腫瘤提示的臨床價值和診斷性能，自 2021 年起杰毅生物與全國多家知名醫院聯合開展臨床研究，以下是相關研究成果。

1.Metagenomic next-generation sequencing to identify pathogens and cancer in lung biopsy tissue

期刊：《eBioMedicine》（2021 IF=11.20）

合作單位：北大人民醫院

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研究概述：

染色體不穩定性作為一種重要的腫瘤標志物，已在科學研究中進行廣泛討論，但在臨床診斷中應用較少。該研究基于 mNGS 可識別宿主染色體不穩定性（CNV）的原理，對 mNGS 用于同時檢測肺活檢組織中的病原體和染色體不穩定性進行了研究，結果顯示，以病理結果為金標準，mNGS 對于惡性腫瘤的臨床診斷敏感性、特異性、準確率分別為 83.7%、97.6%、 92.9%。

2.Simultaneous Detection of Pathogens and Tumors in Patients With Suspected Infections by Next-Generation Sequencing

期刊：《Frontiers in Cellular and Infection Microbiology》?(2022 IF=5.70)?

合作單位：復旦大學附屬華山醫院

研究概述：在經 Onco-mNGS 檢測的 140 例患者中，115 例被診斷為感染性疾??；17 例患者存在明顯的 CNV 異常信號提示惡性腫瘤，并均獲臨床確認。與臨床診斷相比，mNGS 檢測的陽性符合率和陰性符合率分別為 53.0%（61/115）和 60%（15/25），17 例 CNV 異常病例的染色體異常表現包括全基因組變異和特定染色體的局部變異。其中 5 例患者最終確診為惡性腫瘤（包括 3 例肺腺癌和 2 例血液系統腫瘤），1 例患者高度懷疑淋巴瘤，其余 11 例患者則有惡性腫瘤既往史。

這項初步研究證實了使用 Onco-mNGS 在疑似感染患者中同步探尋潛在病原體與惡性腫瘤的可行性及臨床價值。

3.Utility of clinical metagenomicsin diagnosing malignanciesin a cohort of patients withEpstein-Barr virus positivity

期刊：《Frontiers in Cellular and Infection Microbiology》（2023 IF=6.07)

合作單位：復旦大學附屬華山醫院

研究概述：mNGS 應用于 EBV 相關惡性疾病的輔助診斷。對 29 名 EBV 陽性患者進行了外周血的 mNGS 檢測，CNV 分析對腫瘤的敏感性和特異性分別為 90% 和 89.5%。該研究首次使用 mNGS 與 CNV 分析技術對發熱待查隊列中 EBV 陽性患者的惡性腫瘤預警提示。研究表明 mNGS 的病原檢測和 CNV 分析技術有助于鑒別不明原因發熱的 EBV 陽性患者的病原微生物感染與惡性腫瘤。

4.One-step diagnosis of infection and lung cancer using metagenomic sequencing

期刊：《Respiratory Research》（2023 IF=4.7）

合作單位：廣州醫科大學附屬第一醫院

研究概述：傳統檢測方法難以在一次檢測中滿足同時診斷肺癌和感染的多樣化臨床需求。Onco-mNGS 作為一種極具前景的解決方案，應用于感染診斷和腫瘤提示方面均具有良好的性能表現（靈敏度、特異性、準確性高和及時性）。Onco-mNGS 不僅提高了檢測效率，還為早期靶向干預提供了強有力的支持，對患者的治療決策和良好預后均產生了積極影響?；?Onco-mNGS 對 BALF 樣本中 CNV 和微生物特征的深入分析對于肺癌（尤其是非小細胞肺癌）的臨床分型和分期的早期鑒別具有重要的臨床價值。

5.Metagenomic next-generation sequencing and chromosomal copy number variation analysis in cerebrospinal fluid for the detection of meningeal carcinomatosis

期刊：《Journal of Neuro-Oncology》（2023 IF=3.1）

合作單位：首都醫科大學北京宣武醫院

研究概述：傳統腦膜癌?。∕C）的診斷方法學面臨感染與腫瘤鑒別困難、細胞學陽性率低、多次腰穿增加患者負擔以及有創活檢風險高等多重局限。

Onco-mNGS 技術通過整合病原檢測和 CNV 分析為 MC 的精準診斷提供了一個高靈敏度、高特異性且能有效輔助鑒別的強大工具，拓展了 CSF mNGS 在神經腫瘤領域的臨床應用，但仍需通過大規模、多中心的前瞻性研究在多樣化患者隊列中進行驗證，以進一步明確其臨床效用、診斷性能及預測價值。

總結

這些研究共同印證了 Onco-mNGS 技術在不明原因發熱患者中感染和腫瘤排查中作用顯著，檢測性能優異。mNGS 正從單一的 “感染診斷工具” 演變為 “病原微生物與腫瘤聯合檢測的新方案”。未來有望建立多癌種大數據模型，探索腫瘤、遺傳學領域，借助 AI 優化數據分析、推動多方法聯用，助力臨床精準診療?；?“毅達 Lab” 病原體檢測整體解決方案，NGS 本地化用戶不僅可以選擇 mNGS 和 tNGS 并線上機，更能靈活拓展 Onco-mNGS 檢測，實現精準快速病原檢測+腫瘤提示雙重獲益，讓 NGS 本地化開展提質增效。

IDSC 會議回顧 | mNGS 應用探索：特異性腫瘤信號提示，擴展精準診療新思路

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在感染性疾病診療中，多學科緊密協作至關重要，臨床診療實踐亟需科學規范。2025 年 7 月 4-5 日，中國醫藥教育協會感染疾病專業委員會第十一屆學術大會（IDSC2025）在北京盛大召開。本屆 IDSC 會議吸引了逾 2200 名專家學者踴躍參與交流。

病原診斷是感染性疾病診療中的重要一環，本屆 IDSC 學術大會【微生物與病原診斷】論壇，由浙江省人民醫院俞云松教授、中國人民解放軍總醫院第一醫學中心梁志欣教授主持，浙江省人民醫院檢驗中心副主任李曦教授受邀進行 “基于宏基因組人類染色體的疾病診斷” 主題報告。
李曦教授在報告中談到，感染性疾病和癌癥是全球主要致死原因，而感染性疾病的核心難題在于診斷。隨著實驗室檢測技術的快速發展進步，以 mNGS 為代表的先進分子診斷技術在許多復雜、疑難、特殊感染患者診斷中為臨床快速提供病原學依據，發揮關鍵作用。隨著 mNGS 在臨床大量的數據積累，我們發掘 mNGS 檢測中海量的人源核酸序列同樣能在腫瘤領域發揮其價值：通過對人源核酸進行染色體拷貝數變異分析（CNV），可精準識別并特異性提示腫瘤信號。北京大學人民醫院王輝教授團隊和杰毅生物合作的臨床研究顯示，針對肺穿刺標本，與病理檢查結果比較，mNGS 對于惡性腫瘤診斷的臨床敏感性為 83.7%，特異性為 97.6%，準確率為 92.9%。mNGS 在腫瘤信號提示的敏感性、特異性表現佳，臨床應用廣泛。
目前 mNGS 的 CNV 分析多依賴人眼觀察識別，存在誤差和敏感性不足的問題。為此，李曦教授研究團隊正在開發基于杰毅生物 Q-mNGS 的染色體信號的機器學習方法，一方面借助機器學習建立組合模型，為臨床提供更精準的染色體異常信號判斷，從而增加更多客觀依據。另一方面，致力于在更多類型的腫瘤中探尋新的染色體突變模式，將有助于深化對腫瘤的后續認知。近期李曦教授團隊牽頭以浙江省 8 家醫院的真實數據開展回顧性分析研究，初步顯示該模型在血液系統腫瘤樣本中敏感性和特異性較高，有臨床應用價值。
mNGS 技術在不明原因發熱患者中感染和腫瘤排查中作用凸顯，未來有望建立多癌種大數據模型。隨著二代測序等技術推廣和更新，我們期待未來在遺傳學等領域探索，優化人類數據分析，實現多種方法聯用，助力臨床精準診療。